Nel biennio propedeutico viene attribuita notevole importanza all'orientamento e al contenimento della dispersione scolastica, perché si ritiene che la riduzione degli abbandoni e degli insuccessi (più frequenti proprio nei primi anni) sia uno degli obiettivi primari della scuola. Al Molinari gli insegnamenti di Chimica , Fisica e Informatica vengono impartiti fin dal primo anno (Informatica viene trattata nell'ambito di Matematica), sia sotto il profilo teorico che sperimentale, in laboratori molto ben attrezzati.

L'allievo ha così modo di acquisire durante il biennio le basi delle tre discipline che costituiscono un prerequisito irrinunciabile per affrontare i successivi corsi di specializzazione e viene inoltre messo nelle condizioni di indirizzare in modo consapevole la sua scelta per il triennio.

Il biennio propedeutico è comune sia agli indirizzi tecnici che a quello liceale. Le differenze fra i due bienni riguardano esclusivamente Fisica e Chimica (nel Liceo conglobate in Laboratorio di Fisica/Chimica) e di Tecnologia e Disegno (il Liceo prevede più ore di laboratorio in classe seconda), oltre al monte ore settimanale di lezione (che nel Liceo è leggermente minore). L'accesso al triennio di indirizzo viene garantito dalla semplice promozione per scrutinio alla fine del secondo anno.